ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb_frame Class Reference

Public Member Functions
def	__init__ (self, num_atoms=0)
def	calc_centroid (self)
def	get_centroid (self)
def	translate (self, trans)
def	rotate (self, rot)
def	set_step (self, step)
def	reset (self)

Data Fields
	pos
	centroid
	step

Constructor & Destructor Documentation

__init__()

def ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb_frame.__init__	(		self,
			num_atoms = 0
	)

Member Function Documentation

calc_centroid()

def ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb_frame.calc_centroid

(

self

)

Referenced by ffeatools.modules.FFEA_rod.FFEA_rod.rotate(), ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb_frame.rotate(), and ffeatools.modules.FFEA_pdb_OLD.FFEA_pdb_frame.set_pos().

get_centroid()

def ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb_frame.get_centroid

(

self

)

reset()

def ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb_frame.reset

(

self

)

Referenced by ffeatools.modules.FFEA_skeleton.FFEA_skeleton.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_pdb_OLD.FFEA_pdb.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_springs.FFEA_springs.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_vdw.FFEA_vdw.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_pin.FFEA_pin.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_trajectory.FFEA_trajectory.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_stokes.FFEA_stokes.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_topology.FFEA_topology.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_script.FFEA_script.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_surface.FFEA_surface.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_springs.FFEA_spring.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_pdb_OLD.FFEA_pdb_blob.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_trajectory.FFEA_traj_blob.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_pdb_OLD.FFEA_pdb_frame.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_surface.FFEA_face.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_topology.FFEA_element.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_trajectory.FFEA_trajectory.build_from_pdb(), ffeatools.modules.FFEA_pdb_OLD.FFEA_pdb.build_from_traj(), ffeatools.modules.FFEA_trajectory.FFEA_trajectory.load(), ffeatools.modules.FFEA_surface.FFEA_surface.load_face(), ffeatools.modules.FFEA_surface.FFEA_surface.load_vol(), and ffeatools.modules.FFEA_pin.FFEA_pin.pin_radially().

rotate()

def ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb_frame.rotate	(		self,
			rot
	)

set_step()

def ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb_frame.set_step	(		self,
			step
	)

translate()

def ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb_frame.translate	(		self,
			trans
	)

Referenced by ffeatools.modules.FFEA_rod.FFEA_rod.rotate(), ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb_frame.rotate(), and ffeatools.modules.FFEA_pdb_OLD.FFEA_pdb_frame.set_pos().

Field Documentation

centroid

ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb_frame.centroid

Referenced by ffeatools.modules.FFEA_pdb_OLD.FFEA_pdb_frame.get_centroid(), ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb_frame.get_centroid(), ffeatools.modules.FFEA_surface.FFEA_face.get_centroid(), ffeatools.modules.FFEA_topology.FFEA_element.get_centroid(), and ffeatools.modules.FFEA_script.FFEA_script_blob.write_to_file().

pos

ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb_frame.pos

Referenced by ffeatools.modules.FFEA_kinetic_rates.FFEA_kinetic_rates.add_node(), ffeatools.modules.FFEA_pdb_OLD.FFEA_pdb_frame.calc_centroid(), ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb_frame.calc_centroid(), ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb_frame.reset(), ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb_frame.rotate(), ffeatools.modules.FFEA_pdb_OLD.FFEA_pdb_frame.set_atomic_pos(), ffeatools.modules.FFEA_pdb_OLD.FFEA_pdb_frame.translate(), and ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb_frame.translate().

step

ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb_frame.step

Referenced by ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb_frame.reset().

---

The documentation for this class was generated from the following file:

• FFEA_pdb.py