◆ __init__()
def ffeatools.modules.FFEA_lj.FFEA_lj.__init__ |
( |
|
self, |
|
|
|
fname = "" |
|
) |
| |
◆ default()
def ffeatools.modules.FFEA_lj.FFEA_lj.default |
( |
|
self | ) |
|
◆ load()
def ffeatools.modules.FFEA_lj.FFEA_lj.load |
( |
|
self, |
|
|
|
fname |
|
) |
| |
◆ load_lj()
def ffeatools.modules.FFEA_lj.FFEA_lj.load_lj |
( |
|
self, |
|
|
|
fname |
|
) |
| |
◆ reset()
def ffeatools.modules.FFEA_lj.FFEA_lj.reset |
( |
|
self | ) |
|
Referenced by ffeatools.modules.FFEA_lj.FFEA_lj.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_skeleton.FFEA_skeleton.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_vdw.FFEA_vdw.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_springs.FFEA_springs.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_pdb_OLD.FFEA_pdb.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_pin.FFEA_pin.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_node.FFEA_node.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_stokes.FFEA_stokes.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_trajectory.FFEA_trajectory.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_topology.FFEA_topology.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_material.FFEA_material.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_measurement.FFEA_measurement.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_script.FFEA_script.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_surface.FFEA_surface.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_springs.FFEA_spring.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_lj.FFEA_lj_pair.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_pdb_OLD.FFEA_pdb_blob.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_trajectory.FFEA_traj_blob.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_pdb_OLD.FFEA_pdb_frame.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb_atom.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_surface.FFEA_face.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_topology.FFEA_element.__init__(), ffeatools.modules.FFEA_material.FFEA_material.build(), ffeatools.modules.FFEA_trajectory.FFEA_trajectory.build_from_pdb(), ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb.build_from_rod(), ffeatools.modules.FFEA_pdb_OLD.FFEA_pdb.build_from_traj(), ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb.build_from_traj(), ffeatools.modules.FFEA_trajectory.FFEA_trajectory.load(), ffeatools.modules.FFEA_measurement.FFEA_measurement.load_detailed(), ffeatools.modules.FFEA_surface.FFEA_surface.load_face(), ffeatools.modules.FFEA_measurement.FFEA_measurement.load_global(), ffeatools.modules.FFEA_node.FFEA_node.load_vol(), ffeatools.modules.FFEA_surface.FFEA_surface.load_vol(), and ffeatools.modules.FFEA_pin.FFEA_pin.pin_radially().
◆ set_interaction_pair()
def ffeatools.modules.FFEA_lj.FFEA_lj.set_interaction_pair |
( |
|
self, |
|
|
|
i, |
|
|
|
j, |
|
|
|
eps, |
|
|
|
r0 |
|
) |
| |
◆ write_to_file()
def ffeatools.modules.FFEA_lj.FFEA_lj.write_to_file |
( |
|
self, |
|
|
|
fname |
|
) |
| |
◆ empty
ffeatools.modules.FFEA_lj.FFEA_lj.empty |
Referenced by ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb.build_from_rod(), ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb.build_from_traj(), ffeatools.modules.FFEA_skeleton.FFEA_skeleton.reset(), ffeatools.modules.FFEA_lj.FFEA_lj.reset(), ffeatools.modules.FFEA_vdw.FFEA_vdw.reset(), ffeatools.modules.FFEA_stokes.FFEA_stokes.reset(), ffeatools.modules.FFEA_trajectory.FFEA_trajectory.reset(), ffeatools.modules.FFEA_measurement.FFEA_measurement.reset(), ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb.reset(), ffeatools.modules.FFEA_script.FFEA_script.reset(), and ffeatools.modules.FFEA_node.FFEA_node.reset().
◆ interaction
ffeatools.modules.FFEA_lj.FFEA_lj.interaction |
◆ num_face_types
ffeatools.modules.FFEA_lj.FFEA_lj.num_face_types |
◆ valid
ffeatools.modules.FFEA_lj.FFEA_lj.valid |
Referenced by ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb.build_from_rod(), ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb.build_from_traj(), ffeatools.modules.FFEA_trajectory.FFEA_trajectory.load(), ffeatools.modules.FFEA_skeleton.FFEA_skeleton.load(), ffeatools.modules.FFEA_lj.FFEA_lj.load(), ffeatools.modules.FFEA_vdw.FFEA_vdw.load(), ffeatools.modules.FFEA_topology.FFEA_topology.load(), ffeatools.modules.FFEA_pin.FFEA_pin.load(), ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb.load(), ffeatools.modules.FFEA_stokes.FFEA_stokes.load(), ffeatools.modules.FFEA_node.FFEA_node.load(), ffeatools.modules.FFEA_material.FFEA_material.load(), ffeatools.modules.FFEA_surface.FFEA_surface.load(), ffeatools.modules.FFEA_skeleton.FFEA_skeleton.reset(), ffeatools.modules.FFEA_lj.FFEA_lj.reset(), ffeatools.modules.FFEA_vdw.FFEA_vdw.reset(), ffeatools.modules.FFEA_stokes.FFEA_stokes.reset(), ffeatools.modules.FFEA_trajectory.FFEA_trajectory.reset(), ffeatools.modules.FFEA_measurement.FFEA_measurement.reset(), ffeatools.modules.FFEA_pdb.FFEA_pdb.reset(), ffeatools.modules.FFEA_script.FFEA_script.reset(), and ffeatools.modules.FFEA_node.FFEA_node.reset().
The documentation for this class was generated from the following file: